حوزه دانش جویی شریف جهت ارائه‌ی خدمات معرفتی و تربیتی، کلیه فعالیت‌های خود را در قالب سه معاونت پی‌گیری می‌نماید: تعلیم، رسانه و پشتیبانی. مدیریت و راهبری امور معاونت‌ها توسط حجةالاسلام آقانوری (به‌عنوان مسئول حوزه)، با کمک آقای محمدحسین دیانی (به‌عنوان مدیر داخلی حوزه) و سرکار خانم خدری (به‌عنوان مسئول هم‌آهنگی خواهران) انجام می‌شود. همچنین حجج اسلام محمد قمی، مصطفی جلالی، محمدمهدی دادمان در کنار مسئول حوزه (حجةالاسلام آقانوری) به‌عنوان اعضای هیئت‌مدیره حوزه از نظر محتوایی و در سطحی کلان بر عملکرد حوزه نظارت می‌کنند.

تعلیم

این معاونت بر اساس یک طرح جامع آموزشی -که توسط اساتید حوزه طراحی شده است- امور آموزشی را برای معرفت‌جویان مدیریت و اجرا می‌کند. فعالیت‌های محوری این معاونت شامل تنظیم تقویم آموزشی هر ترم، هماهنگی‌های هفتگی با اساتید و مدرسان، هماهنگی‌های آموزشی و اجرایی با معاونت پشتیبانی جهت برگزاری کلاس‌ها، پشتیبانی آموزشی و محتوایی از کلاس‌ها، تعامل با معرفت‌جویان، برگزاری ارزش‌یابی‌های تحصیلی، پی‌گیری دریافت و تصحیح برگه‌های تقریر، و ارائه منابع آموزشی به ایشان است.

در حال حاضر آقایان ابوالفضل عبادی و سید محمدحسن طباییان با همکاری خانم‌ها قاسمی و مرسلی پیشبرد امور این معاونت را بر عهده دارند.

رسانه

به روز رسانی کانال‌ها و صفحات حوزه دانش جویی شریف در فضای مجازی و تولید پرونده‌های محتوایی و آماده کردن گزارش‌های رسانه‌ای از فضای برنامه‌ها و کلاس‌های حوزه، از وظایف رسانه است.

اکنون سرکار خانم متولی، با هم‌راهی و کمک تنی چند از خواهران در این بخش مشغول فعالیت هستند. هم‌چنین مسئولیت به روز رسانی سایت، به عهده ی آقای سعید یوسفی رامندی می‌باشد.

پشتیبانی

معاونت پشتیبانی همان‌طور که از نامش پیداست متولی پشتیبانی عملیاتی از کلیه فعالیت‌ها و برنامه‌های حوزه ازجمله پشتیبانی از برگزاری کلاس‌های آموزشی و برنامه‌های تربیتی، امور مالی-اداری، نیروی انسانی و مدیریت وسایل، تجهیزات و اماکن حوزه دانش جویی شریف است. اموری مانند ایاب و ذهاب اساتید، تأمین مکان برای برنامه‌های مختلف تعلیمی و تربیتی، پشتیبانی صوتی و تصویری کلاس‌ها، تأمین وسایل و تجهیزات مورد نیاز برنامه‌ها، تأمین و ارائه تغذیه (صبحانه و نهار و میان‌وعده‌ها) و تأمین مهد برای فرزندان معرفت‌جویان از جمله فعالیت‌های این معاونت است.

در این معاونت، آقای احمد نعیمی‌پور، مسئولیت کار را به عهده دارند و بزرگوارانی در انجام این کار به ایشان کمک می‌کنند. این افراد عبارتند از آقایان طاهر ساعدی و سید سجاد نجفی و سرکار خانم ارضی.

همچنین برخی دیگر از افراد و نیروهای مؤثر و انقلابی در فعالیت‌های پروژه‌ای یا پاره‌وقت با حوزه‌ی دانش‌جویی شریف هم‌کاری دارند از جمله آقایان علی‌رضا جانعلی‌پور شهرانی، سید امیرحسین عظیمی، عباس شاهوردی، سرکار خانم باغیانی و...